Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLBP1P12271 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms