Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX6A1P12074 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms