Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB1P11230 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms