Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LAMC1P11047 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LAMC1P11047 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms