Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPP1P10451 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPP1P10451 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPP1P10451 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPP1P10451 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPP1P10451 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPP1P10451 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPP1P10451 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPP1P10451 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms