Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HKR1P10072 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HKR1P10072 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HKR1P10072 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HKR1P10072 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms