Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms