Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAA2P0DJI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms