Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD2P0DJD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms