Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms