Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC4P0CG21 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms