Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD48P09326 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD48P09326 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD48P09326 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD48P09326 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD48P09326 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD48P09326 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD48P09326 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD48P09326 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD48P09326 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD48P09326 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD48P09326 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD48P09326 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD48P09326 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms