Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HSP90AB1P08238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HSP90AB1P08238 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms