Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYBBP04839 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYBBP04839 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYBBP04839 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms