Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA2P02652 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA2P02652 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA2P02652 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA2P02652 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA2P02652 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA2P02652 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA2P02652 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA2P02652 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms