Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBB3O95704 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBB3O95704 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBB3O95704 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBB3O95704 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBB3O95704 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APBB3O95704 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APBB3O95704 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APBB3O95704 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms