Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF12O95522 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF12O95522 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms