Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIF4AO95239 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIF4AO95239 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms