Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms