Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF6O75683 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF6O75683 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF6O75683 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF6O75683 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF6O75683 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF6O75683 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF6O75683 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF6O75683 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF6O75683 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF6O75683 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF6O75683 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF6O75683 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF6O75683 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF6O75683 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF6O75683 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SURF6O75683 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF6O75683 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF6O75683 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF6O75683 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms