Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPM3O75607 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPM3O75607 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPM3O75607 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPM3O75607 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPM3O75607 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NPM3O75607 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPM3O75607 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPM3O75607 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPM3O75607 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPM3O75607 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPM3O75607 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPM3O75607 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPM3O75607 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms