Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCATO75600 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCATO75600 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCATO75600 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCATO75600 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCATO75600 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCATO75600 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCATO75600 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCATO75600 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms