Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCBO75439 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms