Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH16O75309 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH16O75309 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH16O75309 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH16O75309 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH16O75309 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms