Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms