Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms