Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMM17BO60830 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms