Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SORBS3O60504 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORBS3O60504 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms