Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms