Protein–RNA interactions for Protein: O43934

MFSD11, UNC93-like protein MFSD11, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD11O43934 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD11O43934 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms