Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH3O43739 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms