Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HTATSF1O43719 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms