Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRC1O43663 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRC1O43663 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRC1O43663 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRC1O43663 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRC1O43663 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRC1O43663 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRC1O43663 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRC1O43663 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRC1O43663 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRC1O43663 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRC1O43663 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms