Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms