Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERI3O43414 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERI3O43414 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERI3O43414 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERI3O43414 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERI3O43414 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERI3O43414 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERI3O43414 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERI3O43414 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERI3O43414 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms