Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSH5O43196 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSH5O43196 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSH5O43196 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSH5O43196 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSH5O43196 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSH5O43196 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSH5O43196 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSH5O43196 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSH5O43196 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSH5O43196 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSH5O43196 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSH5O43196 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSH5O43196 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSH5O43196 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms