Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRXO43186 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRXO43186 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRXO43186 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRXO43186 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRXO43186 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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