Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBDO15205 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBDO15205 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBDO15205 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBDO15205 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBDO15205 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBDO15205 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBDO15205 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBDO15205 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBDO15205 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms