Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBTB39O15060 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBTB39O15060 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBTB39O15060 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms