Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WNT9AO14904 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WNT9AO14904 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms