Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN9O14815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms