Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD12O00232 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms