Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIEO00221 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms