Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NACAE9PAV3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms