Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NOTOA8MTQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms