Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PP2D1A8MPX8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms