Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms