Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms