Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDR42E2A6NKP2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms