Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6CA6NDK9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms